MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corallococcus coralloides DSM 2259 chromosome

Total Repeats: 259209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017030	CTTCGC	2	12	112	123	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383452025
2	NC_017030	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
3	NC_017030	CTGG	2	8	197	204	0 %	25 %	50 %	25 %	383452025
4	NC_017030	CTT	2	6	263	268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452025
5	NC_017030	GTC	3	9	357	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
6	NC_017030	C	6	6	368	373	0 %	0 %	0 %	100 %	383452025
7	NC_017030	CGT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
8	NC_017030	GCC	2	6	392	397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
9	NC_017030	CG	3	6	431	436	0 %	0 %	50 %	50 %	383452025
10	NC_017030	CGT	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
11	NC_017030	CGC	4	12	494	505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
12	NC_017030	CCGG	2	8	521	528	0 %	0 %	50 %	50 %	383452025
13	NC_017030	CGG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452025
14	NC_017030	CCCA	2	8	624	631	25 %	0 %	0 %	75 %	383452025
15	NC_017030	ACGA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	383452025
16	NC_017030	CCG	2	6	710	715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
17	NC_017030	TGC	2	6	739	744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
18	NC_017030	CGA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452025
19	NC_017030	GAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
20	NC_017030	TTC	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452025
21	NC_017030	CAA	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452025
22	NC_017030	GGA	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
23	NC_017030	CG	3	6	949	954	0 %	0 %	50 %	50 %	383452025
24	NC_017030	TCC	2	6	961	966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383452025
25	NC_017030	AGA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452025
26	NC_017030	AGG	2	6	982	987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
27	NC_017030	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452025
28	NC_017030	GC	3	6	1060	1065	0 %	0 %	50 %	50 %	383452025
29	NC_017030	GGA	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
30	NC_017030	TGC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
31	NC_017030	CGTGGA	2	12	1163	1174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383452025
32	NC_017030	AGG	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
33	NC_017030	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	383452025
34	NC_017030	CAA	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452025
35	NC_017030	CCG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
36	NC_017030	GACG	2	8	1388	1395	25 %	0 %	50 %	25 %	383452025
37	NC_017030	CGG	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452025
38	NC_017030	CCG	2	6	1526	1531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452026
39	NC_017030	CCA	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452026
40	NC_017030	GCG	2	6	1590	1595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452026
41	NC_017030	TCT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452026
42	NC_017030	GTC	4	12	1635	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452026
43	NC_017030	CG	3	6	1719	1724	0 %	0 %	50 %	50 %	383452026
44	NC_017030	CCA	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452026
45	NC_017030	CA	3	6	1772	1777	50 %	0 %	0 %	50 %	383452026
46	NC_017030	CAG	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452026
47	NC_017030	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452026
48	NC_017030	GAC	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452026
49	NC_017030	CGTTG	2	10	1882	1891	0 %	40 %	40 %	20 %	383452026
50	NC_017030	TGTC	2	8	2131	2138	0 %	50 %	25 %	25 %	383452027
51	NC_017030	CGG	2	6	2148	2153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
52	NC_017030	ACC	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
53	NC_017030	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452027
54	NC_017030	CGG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
55	NC_017030	CGG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
56	NC_017030	TGGAT	2	10	2459	2468	20 %	40 %	40 %	0 %	383452027
57	NC_017030	CCA	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
58	NC_017030	GC	3	6	2693	2698	0 %	0 %	50 %	50 %	383452027
59	NC_017030	GTG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452027
60	NC_017030	CAC	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
61	NC_017030	CGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452027
62	NC_017030	TGA	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452028
63	NC_017030	TCT	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452028
64	NC_017030	GAACTC	2	12	2995	3006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383452028
65	NC_017030	CGGG	2	8	3063	3070	0 %	0 %	75 %	25 %	383452028
66	NC_017030	TGG	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452028
67	NC_017030	G	6	6	3158	3163	0 %	0 %	100 %	0 %	383452028
68	NC_017030	CGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452028
69	NC_017030	GTGC	2	8	3208	3215	0 %	25 %	50 %	25 %	383452028
70	NC_017030	C	6	6	3308	3313	0 %	0 %	0 %	100 %	383452028
71	NC_017030	CGG	2	6	3323	3328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
72	NC_017030	GCC	2	6	3440	3445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452028
73	NC_017030	GGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452028
74	NC_017030	GGC	2	6	3467	3472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
75	NC_017030	GCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452028
76	NC_017030	CCGG	2	8	3553	3560	0 %	0 %	50 %	50 %	383452028
77	NC_017030	GCG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
78	NC_017030	CGGT	2	8	3690	3697	0 %	25 %	50 %	25 %	383452029
79	NC_017030	CAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452029
80	NC_017030	CAG	3	9	3704	3712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
81	NC_017030	CAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
82	NC_017030	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
83	NC_017030	GCG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
84	NC_017030	CCA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452029
85	NC_017030	CGC	2	6	3826	3831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
86	NC_017030	GC	3	6	3868	3873	0 %	0 %	50 %	50 %	383452029
87	NC_017030	AACCG	2	10	3877	3886	40 %	0 %	20 %	40 %	383452029
88	NC_017030	TTG	2	6	3909	3914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383452029
89	NC_017030	GGC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
90	NC_017030	GAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
91	NC_017030	CCG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
92	NC_017030	GCG	2	6	4090	4095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
93	NC_017030	GAA	2	6	4133	4138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
94	NC_017030	AGC	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
95	NC_017030	TCG	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452029
96	NC_017030	CG	3	6	4196	4201	0 %	0 %	50 %	50 %	383452029
97	NC_017030	GCG	3	9	4221	4229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
98	NC_017030	AGC	3	9	4242	4250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
99	NC_017030	C	6	6	4257	4262	0 %	0 %	0 %	100 %	383452029
100	NC_017030	CATC	2	8	4275	4282	25 %	25 %	0 %	50 %	383452029
101	NC_017030	GC	3	6	4334	4339	0 %	0 %	50 %	50 %	383452029
102	NC_017030	CG	3	6	4362	4367	0 %	0 %	50 %	50 %	383452029
103	NC_017030	AGA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
104	NC_017030	GCC	2	6	4430	4435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
105	NC_017030	CTG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452029
106	NC_017030	CGC	2	6	4642	4647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
107	NC_017030	GTG	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452030
108	NC_017030	ACG	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
109	NC_017030	ATG	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452030
110	NC_017030	GAC	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
111	NC_017030	GGCG	2	8	4942	4949	0 %	0 %	75 %	25 %	383452030
112	NC_017030	CAC	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452030
113	NC_017030	ACT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383452030
114	NC_017030	CTG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452030
115	NC_017030	CTG	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452030
116	NC_017030	AGG	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452030
117	NC_017030	GAA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452030
118	NC_017030	GCC	2	6	5121	5126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
119	NC_017030	CGC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
120	NC_017030	TTC	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452030
121	NC_017030	CGCC	2	8	5286	5293	0 %	0 %	25 %	75 %	383452030
122	NC_017030	TGG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452030
123	NC_017030	CG	3	6	5421	5426	0 %	0 %	50 %	50 %	383452030
124	NC_017030	ACG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
125	NC_017030	CGG	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452030
126	NC_017030	CG	3	6	5555	5560	0 %	0 %	50 %	50 %	383452030
127	NC_017030	GCC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
128	NC_017030	CCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
129	NC_017030	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
130	NC_017030	GC	3	6	5634	5639	0 %	0 %	50 %	50 %	383452030
131	NC_017030	TCT	2	6	5646	5651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452030
132	NC_017030	GGCCC	2	10	5665	5674	0 %	0 %	40 %	60 %	383452030
133	NC_017030	CAC	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452030
134	NC_017030	GAA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452030
135	NC_017030	AGG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452030
136	NC_017030	CG	4	8	5762	5769	0 %	0 %	50 %	50 %	383452030
137	NC_017030	GGC	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452030
138	NC_017030	GCA	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
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241	NC_017030	CGAG	2	8	9656	9663	25 %	0 %	50 %	25 %	383452033
242	NC_017030	CAC	2	6	9738	9743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452033
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245	NC_017030	GGCG	2	8	9765	9772	0 %	0 %	75 %	25 %	383452033
246	NC_017030	TCA	2	6	9807	9812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383452033
247	NC_017030	GT	3	6	9853	9858	0 %	50 %	50 %	0 %	383452033
248	NC_017030	TGG	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452033
249	NC_017030	TGGA	3	12	9908	9919	25 %	25 %	50 %	0 %	383452033
250	NC_017030	AGGCG	2	10	9980	9989	20 %	0 %	60 %	20 %	383452033
251	NC_017030	GGCC	2	8	9994	10001	0 %	0 %	50 %	50 %	383452033
252	NC_017030	AGC	2	6	10021	10026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452033
253	NC_017030	GTG	2	6	10075	10080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452033
254	NC_017030	AAG	2	6	10090	10095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452033
255	NC_017030	GGC	2	6	10106	10111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452033
256	NC_017030	CGG	2	6	10139	10144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452033
257	NC_017030	GGGGC	2	10	10183	10192	0 %	0 %	80 %	20 %	383452033
258	NC_017030	GAA	2	6	10212	10217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452033
259	NC_017030	TGC	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452033
260	NC_017030	CG	3	6	10364	10369	0 %	0 %	50 %	50 %	383452033
261	NC_017030	GC	3	6	10393	10398	0 %	0 %	50 %	50 %	383452033
262	NC_017030	CG	4	8	10413	10420	0 %	0 %	50 %	50 %	383452033
263	NC_017030	GCTGGA	2	12	10434	10445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383452033
264	NC_017030	GGA	2	6	10473	10478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452033
265	NC_017030	GGAA	2	8	10565	10572	50 %	0 %	50 %	0 %	383452033
266	NC_017030	TGC	2	6	10580	10585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452033
267	NC_017030	GGTGCC	2	12	10629	10640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383452033
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389	NC_017030	CGG	2	6	16768	16773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452040
390	NC_017030	GC	3	6	16830	16835	0 %	0 %	50 %	50 %	383452040
391	NC_017030	CGCC	2	8	16887	16894	0 %	0 %	25 %	75 %	383452040
392	NC_017030	TCGC	2	8	16899	16906	0 %	25 %	25 %	50 %	383452040
393	NC_017030	CAC	3	9	16930	16938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452040
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401	NC_017030	CCG	2	6	17305	17310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452041
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432	NC_017030	CAC	2	6	18302	18307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452042
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499	NC_017030	CGG	2	6	20672	20677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452045
500	NC_017030	CGCGT	2	10	20710	20719	0 %	20 %	40 %	40 %	383452045

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